Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms