Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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