Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRHP20396 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRHP20396 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRHP20396 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRHP20396 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRHP20396 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRHP20396 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRHP20396 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRHP20396 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRHP20396 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRHP20396 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRHP20396 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRHP20396 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRHP20396 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRHP20396 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms