Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EGR1P18146 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms