Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms