Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms