Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms