Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSLP07711 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSLP07711 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTSLP07711 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTSLP07711 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTSLP07711 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTSLP07711 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTSLP07711 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTSLP07711 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTSLP07711 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms