Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1BGP04217 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
A1BGP04217 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A1BGP04217 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1BGP04217 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1BGP04217 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A1BGP04217 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A1BGP04217 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A1BGP04217 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A1BGP04217 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms