Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP19O94966 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP19O94966 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP19O94966 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP19O94966 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP19O94966 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms