Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBNO60934 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBNO60934 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NBNO60934 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NBNO60934 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NBNO60934 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NBNO60934 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NBNO60934 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms