Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX15O60248 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms