Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNQ2O43526 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNQ2O43526 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms