Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms