Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCAO15360 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCAO15360 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FANCAO15360 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FANCAO15360 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FANCAO15360 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCAO15360 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCAO15360 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCAO15360 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCAO15360 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCAO15360 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCAO15360 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCAO15360 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCAO15360 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCAO15360 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms