Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNMO15061 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNMO15061 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNMO15061 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNMO15061 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNMO15061 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms