Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms