Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms