Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIP1O00291 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIP1O00291 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms