Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms