Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A8MVJ9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A8MVJ9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms