Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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