Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSDA5PKW4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms