Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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