Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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