Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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ZNF548Q8NEK5 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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