Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ECM1Q16610 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ECM1Q16610 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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