Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NTRK3Q16288 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK3Q16288 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK3Q16288 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK3Q16288 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NTRK3Q16288 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NTRK3Q16288 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms