Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
TAF1CQ15572 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TAF1CQ15572 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1CQ15572 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms