Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCINQ13939 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCINQ13939 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCINQ13939 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCINQ13939 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCINQ13939 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCINQ13939 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CCINQ13939 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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