Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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