Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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