Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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FOXF2Q12947 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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FOXF2Q12947 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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FOXF2Q12947 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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FOXF2Q12947 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXF2Q12947 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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