Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms