Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BRPF3Q9ULD4 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRPF3Q9ULD4 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRPF3Q9ULD4 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRPF3Q9ULD4 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRPF3Q9ULD4 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRPF3Q9ULD4 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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