Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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