Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PHACTR1Q9C0D0 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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