Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSPP1Q1MSJ5 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSPP1Q1MSJ5 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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