Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIXQ14938 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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NFIXQ14938 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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NFIXQ14938 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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NFIXQ14938 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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NFIXQ14938 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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NFIXQ14938 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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