Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
OTOP3Q7RTS5 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
OTOP3Q7RTS5 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.8 ms