Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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