Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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USP53Q70EK8 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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USP53Q70EK8 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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USP53Q70EK8 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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USP53Q70EK8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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USP53Q70EK8 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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