Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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