Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK4Q16099 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms