Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPS72Q15906 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VPS72Q15906 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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