Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
TWIST1Q15672 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TWIST1Q15672 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms