Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
AP3B2Q13367 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
AP3B2Q13367 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms