Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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