Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAPPC9Q96Q05 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms