Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PTPROQ16827 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPROQ16827 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPROQ16827 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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PTPROQ16827 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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PTPROQ16827 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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PTPROQ16827 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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